O Programa de Pós-graduação em Ciências Militares oferece a possibilidade de estágio pós-doutoral para doutores que desejem se especializar e aprofundar pesquisas em temas relacionados às pesquisas desenvolvidas no Instituto Meira Mattos. A pesquisa pós-doutoral deve ser acompanhada por um docente vinculado ao PPGCM-IMM. Desse modo, o programa busca contribuir para o desenvolvimento de pesquisa científica no Brasil nas áreas de Ciências Militares e de Defesa Nacional.